公司与员工之间的劳动关系是由劳动合同约定的，但是在实际工作中难免会发生争议。当双方无法协商解决时，员工可以向劳动仲裁机构申请仲裁。然而，有些公司会拒绝参加劳动仲裁，这是否合法呢？

首先，需要明确的是，拒绝参加劳动仲裁是不合法的。根据《中华人民共和国劳动法》第四十一条规定：“劳动者与用人单位发生劳动争议，应当协商解决。协商不成，可以申请仲裁或者向人民法院提起诉讼。”这说明员工有权利申请仲裁，而用人单位则有义务参加仲裁，否则将面临相应的法律后果。

那么，为什么有些公司会拒绝参加劳动仲裁呢？主要原因是担心在仲裁中败诉，导致经济损失和声誉受损。此外，还有一些公司认为仲裁机构的裁决结果可能不公正，因此选择拒绝参加。

然而，这些担忧并不成立。首先，劳动仲裁机构是由政府设立的，其裁决结果具有法律效力，用人单位必须遵守。其次，仲裁机构会根据法律规定和实际情况进行公正裁决，不会偏袒任何一方。因此，用人单位拒绝参加劳动仲裁是不明智的，也是不合法的。

根据《中华人民共和国劳动法》第四十一条和《中华人民共和国劳动仲裁法》第十五条规定，用人单位拒绝参加劳动仲裁的，劳动仲裁机构可以依法进行调解或者裁决，并可以对用人单位处以罚款等行政处罚。