在离婚时，对于两个孩子的抚养权问题，根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，法院在判决时会考虑多种因素，以确保最终的判决符合孩子的最佳利益，法院会考虑孩子的年龄、健康状况、情感依赖以及父母的抚养能力、经济状况、教育水平等，对于两岁以下的孩子，通常会判给母亲抚养，除非母亲存在不利于孩子成长的情形，对于两岁以上的孩子，如果父母双方对抚养权有争议，法院可能会考虑将孩子判给能够提供更稳定生活环境和更好教育条件的一方，在某些情况下，法院可能会判决一人抚养一个孩子，以平衡父母的抚养责任和孩子的成长环境，离婚时孩子的抚养权判决是一个综合考虑多种因素的过程，最终目的是为了孩子的最佳利益。

建议参考：

在处理离婚时孩子的抚养权问题时，建议双方父母首先尝试通过协商达成一致意见，这样可以减少诉讼过程中的紧张和敌对情绪，也有利于孩子的心理健康，如果协商不成，建议寻求专业律师的帮助，律师可以提供专业的法律意见和谈判策略，帮助父母更好地维护自己的权益和孩子的利益。

相关法条：

《中华人民共和国民法典》第一千零八十四条：“父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除，离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。

离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。

离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则，已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决，子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。”

小编总结：

在民法典时代下，离婚时两个孩子的抚养权问题应当根据《中华人民共和国民法典》的相关规定进行处理，法院在判决时会考虑孩子的最佳利益，综合考虑多种因素，包括孩子的年龄、健康状况、情感依赖以及父母的抚养能力、经济状况、教育水平等，父母在处理此类问题时，应当首先尝试协商解决，如果协商不成，可以寻求专业律师的帮助，通过合法、合理的方式解决抚养权问题，对于孩子的成长和父母的权益都至关重要。