一是赔偿原则不同。根据的规定，对机动车发生交通事故造成人身伤亡、财产损失的，由保险在交强险责任限额范围内予以赔偿。而商业三者险中，保险公司是根据投保人或被保险人在交通事故中应负的责任来确定赔偿责任。

二是保障范围不同。交强险的保障范围广，商业险的保障范围相对狭窄。发生保险事故，交强险不仅承担被保险人有责任时依法应由被保险人承担的损害赔偿责任，而且还承担被保险人无责任时其相应的损害赔偿责任;而商业三者险在被保人无责任(或无过错)的情况下，保险人不承担赔偿责任。另外在商业第三者责任保险条款的“责任免除”项下还列明了许多保险人不承担赔偿的情况。

三是具有的强制性不同。根据《机动车交通事故责任强制保险条例》的规定，机动车的所有人或管理人都应当投保交强险，同时，保险公司不能拒绝承保、不得拖延承保和不得随意。而商业三者险不具有强制性，投保人与保险公司在自愿、平等的条件下订立保险合同。

四是保险费率不同。根据《机动车交通事故责任强制保险条例》规定，交强险实行全国统一的保险条款和基础费率，保监会按照交强险业务总体上“不盈利不亏损”的原则审批费率。而商业三责险是以盈利为目的，保险费率也较高。商业险的保费取决于很多因素，如保险金额、车型、车龄等。

五是赔偿限额不同。交强险实行分项责任限额。交强险合同约定对每次事故在一定项目下的赔偿限额内负责赔偿，如死亡伤残赔偿限额为5万元，医疗费用赔偿限额为8000元等。商业第三者责任保险的赔偿限额可由被保险人在5万元至100万元或以上中自己选择，远远高于交强险。