法律解析：

中药品种保护证书的审批和核发部门是国家药品监督管理局。

中药品种保护制度是对中药知识产权的一种保护措施。国家药品监督管理局负责中药品种保护的审批和核发工作。

中药品种保护的目的在于鼓励研制开发临床有效的中药品种，提高中药品种的质量，保护中药生产企业的合法权益，促进中药事业的发展。

国家药品监督管理局在审批和核发中药品种保护证书时，会依据相关法律法规和规定，对申请保护的中药品种进行严格的审查和评估。这包括对该中药品种的安全性、有效性、质量可控性等方面的考量。

只有符合特定条件和标准的中药品种，才能够获得中药品种保护证书。获得保护证书的中药品种，在保护期内享有一系列的保护措施和权益。例如，其他企业不得仿制该品种，从而保障了该中药品种的市场独占性。

国家药品监督管理局还会对已获得保护证书的中药品种进行监督管理，以确保其在保护期内持续符合相关要求。如果发现存在问题或不符合规定的情况，可能会采取相应的措施，包括撤销保护证书等。

总之，国家药品监督管理局在中药品种保护证书的审批和核发中起着关键的作用，通过这一机制，有助于推动中药行业的健康发展和创新。

法律依据：

《中药品种保护条例》第九条

申请办理中药品种保护的程序：

（一）中药生产企业对其生产的符合本条例第五条、第六条、第七条、第八条规定的中药品种，可以向所在地省、自治区、直辖市人民政府药品监督管理部门提出申请，由省、自治区、直辖市人民政府药品监督管理部门初审签署意见后，报国务院药品监督管理部门。特殊情况下，中药生产企业也可以直接向国务院药品监督管理部门提出申请。

（二）国务院药品监督管理部门委托国家中药品种保护审评委员会负责对申请保护的中药品种进行审评。国家中药品种保护审评委员会应当自接到申请报告书之日起六个月内作出审评结论。

（三）根据国家中药品种保护审评委员会的审评结论，由国务院药品监督管理部门决定是否给予保护。批准保护的中药品种，由国务院药品监督管理部门发给《中药保护品种证书》。