法律解析：

在男方申诉离婚而女方失踪的情况下，可以通过一定的法律程序来处理。

当遇到男方申诉但女方失踪的情况时，首先男方需要确定女方失踪的具体情形。如果女方只是暂时无法联系上，但可能在一段时间后会出现，男方可以尝试通过各种途径寻找女方，比如联系女方的亲朋好友等。

如果女方确实长期失踪，下落不明，男方可以向法院申请宣告女方失踪。根据法律规定，公民下落不明满二年的，利害关系人可以向人民法院申请宣告他为失踪人。在宣告女方失踪后，男方可以依据相关法律规定向法院提起。

在诉讼过程中，法院会依法进行公告送达，以保障女方的诉讼权利。公告期满后，女方仍未出现的，法院可以依法缺席审理并作出判决。在判决离婚时，法院会综合考虑双方的婚姻状况、夫妻感情等因素。

男方需要提供充分的证据来证明夫妻感情确已破裂，比如双方长期分居、存在不可调和的矛盾等。同时，男方还需要妥善处理好夫妻共同财产、子女抚养等问题。如果有子女，法院会根据子女的最佳利益原则来确定抚养权归属。

总之，在这种复杂的情况下，男方应该及时咨询专业，了解具体的法律程序和应对策略，以确保自身的合法权益得到妥善保障。法律程序的正确运用和证据的充分准备是至关重要的。

法律依据：

《中华人民共和国民法典》 第一千零七十九条

夫妻一方要求离婚的，可以由有关组织进行调解或者直接向人民法院提起离婚诉讼。

人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。

有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：

（一）重婚或者与他人同居；

（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；

（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；

（四）因感情不和分居满二年；

（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。

一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。

经人民法院判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。