法律解析：

子女抚养权变更协议通常可以去法院办理相关手续。

在涉及子女抚养权变更时，去法院办理手续是较为常见和可靠的方式。

法院具有权威性和公正性，能够确保变更协议的合法性和有效性。通过法院的审查和确认，可以给予各方更有力的保障。

当父母双方协商一致，希望变更子女抚养权时，可以共同向有管辖权的法院提起变更抚养权的诉讼。在诉讼过程中，需要提交相关证据，如能够证明变更抚养权对子女更为有利的证据，包括但不限于双方的抚养能力、抚养条件的变化、子女的意愿等。

法院会对双方提交的证据和陈述进行审查和判断，以确定是否符合变更抚养权的条件。如果法院认为变更抚养权是合理且有利于子女成长的，通常会作出相应的判决或裁定，确认抚养权的变更。

在一些地区，可能也可以通过公证机关对子女抚养权变更协议进行公证。公证后的协议也具有一定的法律效力，但在某些情况下，可能仍需要经过法院的确认。

需要注意的是，无论选择哪种方式，都应当以保障子女的最佳利益为出发点。抚养权的变更应当慎重考虑，确保新的抚养环境和条件能够真正有利于子女的身心健康和全面发展。同时，父母双方也应当在变更过程中保持良好的沟通和合作，尽量减少对子女的负面影响。

法律依据：

《最高人民法院关于适用 婚姻家庭编的解释（一）》 第五十六条

具有下列情形之一，父母一方要求变更子女抚养关系的，人民法院应予支持：

（一）与子女共同生活的一方因患严重疾病或者因伤残无力继续抚养子女；

（二）与子女共同生活的一方不尽抚养义务或有虐待子女行为，或者其与子女共同生活对子女身心健康确有不利影响；

（三）已满八周岁的子女，愿随另一方生活，该方又有抚养能力；

（四）有其他正当理由需要变更。