法律解析：

怀孕三个月离婚，法院通常会综合多方面因素进行判决，一般会倾向于保护女方和胎儿的权益。

在女方怀孕三个月时，这是一个较为特殊的情况。法院在判决时会慎重考虑各种因素。会关注夫妻双方的意愿和具体情况。如果是女方提出离婚，法院会审查其离婚理由是否充分合理；如果是男方提出，在一般情况下，法律可能会有一定限制，除非有特殊情形，比如女方存在重大过错等。

法院会考量双方的经济状况、抚养能力等。毕竟即将出生的孩子需要稳定的生活环境和经济保障。如果女方有较好的抚养条件和意愿，可能在抚养权方面会更有优势。

同时，财产分割方面也会根据法律规定和实际情况进行公平合理的分配。可能会适当照顾女方和胎儿的利益，比如在住房等方面给予一定倾斜。

法院还会考虑到孩子未来的成长和教育需求。判决结果要尽可能保障孩子的权益，使其能够在相对稳定和适宜的环境中成长。

需要强调的是，离婚对于怀孕的女方来说是一个重大的人生决策，不仅涉及到自身的情感和生活，还关系到胎儿的未来。在做出决定之前，应该充分考虑清楚，并寻求专业的法律建议和心理支持，以做出最符合自身利益和孩子利益的选择。

法律依据：

《中华人民共和国民法典》 第一千零八十四条

父母与子女间的关系，不因父母离婚而消除。离婚后，子女无论由父或者母直接抚养，仍是父母双方的子女。

离婚后，父母对于子女仍有抚养、教育、保护的权利和义务。

离婚后，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母双方对抚养问题协议不成的，由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。