法律解析：

食品安全检查不合格的处罚方式根据具体情况而定，可能包括责令改正、警告、罚款、没收违法所得、责令停产停业、吊销许可证等。

食品安全是关系到公众健康的重要问题，对于食品安全检查不合格的情况，相关部门会根据具体的违法情节和危害程度进行相应的处罚。

首先，对于一些轻微的违规行为，可能会责令当事人改正，并给予警告。例如，食品标签标识不符合规定、食品储存条件不符合要求等，相关部门会要求当事人立即采取措施进行整改，并对其进行警告，以督促其重视食品安全问题。

如果违法行为较为严重，可能会处以罚款。罚款的数额会根据违法所得、违法情节等因素进行确定。例如，生产销售不符合食品安全标准的食品，或者使用过期原料生产食品等，相关部门会根据法律法规的规定，对当事人处以相应的罚款，以惩罚其违法行为，并起到警示作用。

对于存在违法所得的情况，相关部门会依法没收违法所得。这是为了防止当事人通过违法行为获取不正当利益，同时也是对违法行为的一种惩罚措施。

如果食品安全问题较为严重，可能会责令当事人停产停业。例如，生产场所卫生条件严重不符合要求，或者多次出现食品安全问题未得到有效整改等，相关部门会责令当事人停止生产经营活动，进行整顿，直至达到食品安全要求为止。

在极其严重的情况下，可能会吊销当事人的许可证。例如，生产销售有毒有害食品，或者严重违反食品安全法律法规，造成严重后果的，相关部门会依法吊销其生产经营许可证，使其失去从事相关行业的资格。

总之，食品安全检查不合格的处罚是为了保障公众的健康和安全，维护市场秩序。当事人应当严格遵守食品安全法律法规，确保食品的安全和质量。

法律依据：

《中华人民共和国食品安全法》 第一百二十四条

违反本法规定，有下列情形之一，尚不构成犯罪的，由县级以上人民政府食品安全监督管理部门没收违法所得和违法生产经营的食品、食品添加剂，并可以没收用于违法生产经营的工具、设备、原料等物品；违法生产经营的食品、食品添加剂货值金额不足一万元的，并处五万元以上十万元以下罚款；货值金额一万元以上的，并处货值金额十倍以上二十倍以下罚款；情节严重的，吊销许可证：

（一）生产经营致病性微生物，农药残留、兽药残留、生物毒素、重金属等污染物质以及其他危害人体健康的物质含量超过食品安全标准限量的食品、食品添加剂。